一日，兽化兵正在追捕并准备回收流落到日本的“强殖装甲·单元”，战斗中把“强殖装甲·单元”散落在一间学校后山。一个平凡的中学生深町晶偶然拾到神秘组织克诺斯的超级生体兵器“强殖装甲·单元”，因意外下启动控制装置而得到殖装成加尔巴的能力，成为第一位殖装体Guyver 1（凯普1号），并与图谋征服世界的克诺斯展开激战，后来遇上本为克诺斯干部的卷岛颚人，发现其身份原来是以打倒克诺斯为目标的Guyver 3（凯普3号），Guyver 1、3再联合兽神将试验体的村上征树，一起为打倒克诺斯而战斗......
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